| 1. | Such effects are unaccounted in standard molecular mechanics.
De tels effets ne sont pas pris en compte en mécanique moléculaire classique. |
| 2. | Molecular mechanics – uses Newtonian mechanics to model molecular systems.
La mécanique moléculaire correspond à l'utilisation de la mécanique newtonienne pour modéliser des systèmes moléculaires. |
| 3. | For very large systems, the relative total energies can be compared using molecular mechanics.
Pour des systèmes très étendus, l'énergie totale est déterminée par mécanique moléculaire. |
| 4. | Molecular mechanics Modeling of the intra- and inter-molecular interaction potential energy surfaces via potentials.
Mécanique moléculaire Modélisation des interactions intra- et inter-moléculaires et des surfaces d'énergie potentielle. |
| 5. | At the same time, the methods of molecular mechanics, such as MM2 force field, were developed, primarily by Norman Allinger.
Dans le même temps, les méthodes de mécanique moléculaire, comme MM2, étaient développées, en premier lieu par Norman Allinger. |
| 6. | Molecular mechanics simulations, for example, use one classical expression for the energy of a compound, for instance the harmonic oscillator.
Les simulations de mécanique moléculaire, par exemple, utilisent une simple expression classique pour l'énergie d'un composé, comme celle de l'oscillateur harmonique. |
| 7. | Partial atomic charges are used in molecular mechanics force fields to compute the electrostatic interaction energy using Coulomb's law.
Les charges partielles sont utilisées en mécanique moléculaire des champs de force, pour calculer l'énergie d'interaction donnée par la loi de Coulomb. |
| 8. | Hence, the potentials describing protein folding or ligand binding must be weaker than potentials in molecular mechanics.
Par conséquent, les potentiels décrivant le repliement des protéines ou la liaison de ligand doivent être plus faibles que les potentiels en mécanique moléculaire. |
| 9. | There is also an opinion that molecular mechanics may operate with energy which is irrelevant to protein folding or ligand binding.
Il existe également une opinion selon laquelle la mécanique moléculaire peut opérer avec une énergie non pertinente pour le repliement des protéines ou la liaison de ligand. |
| 10. | These calculations are performed using a molecular mechanics force field; proteins are normally too large even for semi-empirical quantum mechanics-based calculations.
Ces calculs sont effectués à l’aide d’un champ de force de mécanique moléculaire ; les protéines sont normalement trop grandes même pour des calculs semi-empiriques basée sur la mécanique quantique. |
